- Xây dựng nâng cấp hệ thống viễn thông kết nối giữa các cơquan hải quan. Hệ thống này phải trang bị đầy đủ các hạng mục gồm: thiết lập hệ thống các trạm máy chủ tại các hải quan khu vực, vùng; cung cấp đầy đủ máy tính cá nhân cho cán bộ hải quan có kết nối internet tốc độ cao; thiết lập và nâng cấp song song 2 phân hệ chính thức và 

dự phòng khi có sự cố; kết nối hệ thống công nghệ thông tin của hải quan với hệ thống viễn thông vệ tinh để giám sát chu trình đường đi của hàng hóa, phương tiện vận tải 

xuất nhập cảnh giữa hải quan các vùng với nhau; cung cấp dịch vụ công trực tuyến ngành hải quan mức độ 4 và kết nối, chia sẻ thông tin với bộ, ngành. Ngoài ra hệ thống 

lõi này phải được tích hợp đầy đủ kết nối xử lýkịp thời với các hệ thống kết toán thuế(KT559),  hệ thống  thanh  toán  thuế qua  ngân  hàng  (E-Payment),  hệ thống  theo  dõi 

thanh  khoản điện  tử cho  loại  hình  gia  công,  sản  xuất  xuất  khẩu,  chế xuất,  hệ thống phục vụ công tác trị giá tính thuế (GTT 01), hệ thống quản lýrủi ro (Risk man).

- Kết nối thông tin, dữ liệu quản lý của các Bộ ngành trên cơ sở xây dựng cơ chế một cửa quốc gia và tiến tới hoàn thiện Chính phủ điện tử. Khi thực hiện TTHQĐT thì một trong những yếu tố quan trọng hàng đầu là phải tập trung hóa dữ liệu thông tin, không thể để doanh nghiệp khai báo tờ khai hải quan điện tử trong khi phải đi đến từng bộ ngành để xin cấp phép bằng văn bản giấy, điều này gây khó khăn và tăng chi phí rất lớn cho doanh nghiệp. Đối với cơ quan hải quan không có thông tin dữ liệu điện tử về quản lý chuyên ngành sẽ khó quyết định thông quan giải phóng hàng hóa cho doanh nghiệp và bản thân các bộ ngành sẽ khó theo dõi việc giám sát quản lý sau cấp phép về hàng hóa xuất nhập khẩu. 

- Hoàn thiện tổng thể về Chính phủ điện tử trong công tác quản lý nhà nước đến năm 2020 với trình độ dịch vụ công đạt cấp 4 (cho phép thanh toán lệ phí được thực 

hiện trực tuyến. Việc trả kết quả có thể được thực hiện trực tuyến, gửi trực tiếp hoặc qua đường bưu điện đến người sử dụng). 

- An ninh, an toàn hệ thống thực hiện thủ tục hải quan điện tử của cơ quan hải quan và cả doanh nghiệp. (1) Thực hiện cài đặt và thiết lập các lớp firewall ở hệ thống 

đầu tiếp nhận và bên trong đầu xử lýphân luồng hồ sơhải quan để chống lại các cuộc tấn  công  từ môi  trường  bên  ngoài như hacker,  virus,  spam….bảo  vệ hệ thống  giảm thiểu tối đa các ảnh hưởng xấu từ bên ngoài. (2) Đẩy mạnh áp dụng chữ ký số, chữ ký điện tử vào tất cả các khâu nghiệp vụ trong dây chuyền thủ tục hải quan điện tử khi đăng nhập và xử lýdữ liệu của của cơquan hải quan và hệ thống khai báo quản trị của doanh nghiệp.